دستگاه توالی یابی DNA

معرفی دستگاه توالی یابی DNA

دستگاه توالی یابی ION Proton Benchtop DNA Sequencing System از شرکت Thermo Fisher Scientific یک سیستم توالی‌یابی نسل جدید (NGS) است که با فناوری نیمه‌رسانایی منحصر به فرد خود، انقلابی در تحقیقات ژنومیک ایجاد کرده است. این دستگاه با طراحی رومیزی، امکان انجام تحقیقات پیشرفته ژنتیکی را در فضای محدود آزمایشگاهی فراهم می‌آورد.

اصول عملکرد و فناوری پیشرفته:

این سیستم از یک تراشه نیمه‌رسانای حساس استفاده می‌کند که قادر به تشخیص پروتون‌های آزاد شده در هنگام ادغام نوکلئوتیدها در رشته DNA است. این فناوری منحصر به فرد امکان تولید 60 تا 80 میلیون خوانش را تنها در 2.5 ساعت فراهم می‌سازد.

مزایای کلیدی دستگاه:

• سرعت فوق‌العاده: توالی‌یابی ژنوم انسان در چند ساعت

• دقت بالا: فناوری تشخیص پروتون با حساسیت بی‌نظیر

• کارایی عالی: توانایی پردازش انواع نمونه‌های DNA و RNA

• طراحی جمع‌وجور: مناسب برای فضای محدود آزمایشگاهی

• هزینه بهینه: کاهش هزینه‌های عملیاتی نسبت به سیستم‌های مشابه

کاربردهای تخصصی:

1. توالی‌یابی اگزوم (Exome Sequencing):

   • بررسی مناطق کدکننده ژنوم

   • شناسایی جهش‌های مرتبط با بیماری‌ها

2. رونویسی‌ها (Transcriptome Sequencing):

   • مطالعه بیان ژن‌ها

   • شناسایی splice variantها

3. De Novo:

   • توالی‌یابی ژنوم‌های جدید

   • مطالعات ژنتیک تکاملی

4. RNA کوچک:

   • بررسی miRNAها و سایر RNAهای غیرکدکننده

5. کل رونویسی‌ها:

   • مطالعات جامع بیان ژن

حوزه‌های تحقیقاتی قابل استفاده:

• تحقیقات سرطان: شناسایی جهش‌های سوماتیک

• تحقیقات سلول‌های بنیادی: مطالعه تمایز سلولی

• اپی‌ژنتیک: بررسی تغییرات اپی‌ژنتیکی

• ژنومیک DNA باستانی: مطالعات تکاملی و باستان‌شناسی

• متاژنومیکس: مطالعه جامعه میکروبی

• تحقیقات کشاورزی: بهبود نژاد گیاهان و دام

مشخصات فنی کلیدی:

• توان عملیاتی: 10-100 Gb در هر ران

• طول خوانش: تا 200 جفت باز

• زمان اجرا: 2.5-4 ساعت برای توالی‌یابی

• حجم نمونه ورودی: 50-100 نانوگرم DNA

کیت‌ها و مواد مصرفی:

• تراشه‌های Ion Proton (I/II/III)

• کیت‌های آماده‌سازی کتابخانه

• معرف‌های توالی‌یابی

• کیت‌های کنترل کیفیت

نرم‌افزارهای تحلیلی:

• Torrent Suite: برای پردازش اولیه داده‌ها

• ION Reporter: برای آنالیزهای پیشرفته

• Integrative Genomics Viewer (IGV): برای نمایش بصری داده‌ها

گارانتی و پشتیبانی:

• گارانتی 1 ساله قطعات و عملکرد

• پشتیبانی فنی 24/7 توسط متخصصان ترموفیشر

• دوره‌های آموزشی تخصصی برای کاربران

نتیجه‌گیری:

دستگاه ION Proton Benchtop DNA Sequencing System با ترکیب سرعت، دقت و کارایی بالا، گزینه‌ای ایده‌آل برای مراکز تحقیقاتی است که به دنبال دستگاهی پیشرفته با هزینه بهینه هستند. این سیستم با توان عملیاتی بالا و طراحی رومیزی، امکان انجام تحقیقات ژنومیک پیشرفته را در هر آزمایشگاهی فراهم می‌کند.